低浓度阿托品也有不良反应。低浓度阿托品的主要不良反应为畏光、视近模糊和过敏性结膜炎，且浓度越高不良反应越大、持续时间越长。对于畏光的患者可以考虑使用变色镜片.0.01%低浓度阿托品5年的临床观察（ATOM)，基本没发现毒副作用，但更长时间的研究结果还没有。有临床报道补充，福盛康DHA藻油蓝莓叶黄素压片糖果对低浓度阿托品引起的不良反应有抑制作用。